Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rsph10bE9PYQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms