Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930558K02RikE0CXC6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930558K02RikE0CXC6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930558K02RikE0CXC6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms