Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc78D3Z5T1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc78D3Z5T1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms