Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm1330D3Z460 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm1330D3Z460 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms