Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim12cD3Z3L3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim12cD3Z3L3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim12cD3Z3L3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms