Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
3425401B19RikD3Z1D3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms