Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem200bD3Z0P8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem200bD3Z0P8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms