Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc8D3YZV8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc8D3YZV8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms