Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kif28pD3YXS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kif28pD3YXS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kif28pD3YXS5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms