Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BC048679D3YXE9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms