Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rexo5D3YW29 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms