Protein–RNA interactions for Protein: D2EAC2

Zbed6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed6D2EAC2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zbed6D2EAC2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zbed6D2EAC2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zbed6D2EAC2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms