Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna7C0LLJ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna7C0LLJ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna7C0LLJ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms