Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf11cB4XVP9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf11cB4XVP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms