Protein–RNA interactions for Protein: B2RWS6

Ep300, Histone acetyltransferase p300, mousemouse

Predictions only

Length 2,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep300B2RWS6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ep300B2RWS6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ep300B2RWS6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms