Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clrn2B2RVW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clrn2B2RVW2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clrn2B2RVW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms