Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AU015836B2RUM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AU015836B2RUM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AU015836B2RUM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms