Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprbB2RU80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprbB2RU80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprbB2RU80 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms