Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc22a28B2RT89 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms