Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol7aB2RT54 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms