Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfc3h1B2RT41 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfc3h1B2RT41 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfc3h1B2RT41 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms