Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrn3B2RS91 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rrn3B2RS91 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms