Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
JrklB2RRL2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrklB2RRL2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrklB2RRL2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms