Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf3B2RQG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf3B2RQG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms