Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930402K13RikB1AW18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930402K13RikB1AW18 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930402K13RikB1AW18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930402K13RikB1AW18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms