Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scml2B1AVB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scml2B1AVB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scml2B1AVB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms