Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trabd2bB1ATG9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trabd2bB1ATG9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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