Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2al2bA9Z055 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al2bA9Z055 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2al2bA9Z055 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms