Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3173A6NAS3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3173A6NAS3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms