Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc38A3KMP2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc38A3KMP2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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