Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prr16A3KMN5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr16A3KMN5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms