Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Odf2A3KGV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Odf2A3KGV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf2A3KGV1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms