Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc9bA3KGF9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc9bA3KGF9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms