Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp8b5A3FIN4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp8b5A3FIN4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp8b5A3FIN4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms