Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samt1A2BED8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms