Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3aA2ASI5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3aA2ASI5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms