Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll9A2APC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll9A2APC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms