Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syndig1A2ANU3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms