Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cavin4A2AMM0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin4A2AMM0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin4A2AMM0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms