Protein–RNA interactions for Protein: A2ALS5

Rap1gap, Rap1 GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1gapA2ALS5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rap1gapA2ALS5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rap1gapA2ALS5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rap1gapA2ALS5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms