Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec16aA2AIX1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms