Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ambra1A2AH22 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ambra1A2AH22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ambra1A2AH22 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms