Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2dnl2A2AFH2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms