Protein–RNA interactions for Protein: A2AEU1

Mcf2, Mcf.2-transforming sequence, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2A2AEU1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mcf2A2AEU1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mcf2A2AEU1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mcf2A2AEU1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms