Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700023F06RikA2AB62 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700023F06RikA2AB62 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms