Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprfA2A8L5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprfA2A8L5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms