Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sppl2cA2A6C4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sppl2cA2A6C4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms