Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fam71e1A1L3C1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Fam71e1A1L3C1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam71e1A1L3C1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam71e1A1L3C1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms