Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms