Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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